2014年6月， 召開建設(shè)啟動(dòng)儀式，會(huì)上簽訂了《合肥市人民政府與中科院合肥物質(zhì)科學(xué)研究院合作共建“合肥創(chuàng)新院”戰(zhàn)略合作協(xié)議書》。

2014年7月， 合肥創(chuàng)新院完成企業(yè)法人登記、注冊(cè)工作。

2014年11月，合肥創(chuàng)新院完成地方事業(yè)法人注冊(cè)、登記工作。

2015年12月，合肥創(chuàng)新院被認(rèn)定為安徽省新型研發(fā)機(jī)構(gòu)。

2016年7月，合肥創(chuàng)新院被列為“安徽省系統(tǒng)推進(jìn)全面創(chuàng)新改革試驗(yàn)”全省11個(gè)試點(diǎn)單位之一。  

2017年5月，位于習(xí)友路2666號(hào)的合肥創(chuàng)新院研發(fā)樓正式啟用。

2017年12月，中科科技創(chuàng)業(yè)服務(wù)中心被認(rèn)定為國(guó)家級(jí)科技企業(yè)孵化器。

2018年10月，入選國(guó)家發(fā)改委發(fā)布的《全面創(chuàng)新改革試驗(yàn)百佳案例》。

2019年9月，長(zhǎng)江中游城市群新型研發(fā)機(jī)構(gòu)（產(chǎn)研院）戰(zhàn)略聯(lián)盟成立大會(huì)在合肥創(chuàng)新院舉辦。

2020年8月，合肥創(chuàng)新院獲批安徽省第十一批省級(jí)博士后科研工作站。

2020年12月，合肥創(chuàng)新院研究成果獲“2020中國(guó)企業(yè)改革發(fā)展優(yōu)秀成果”一等獎(jiǎng)。

2021年8月，合肥創(chuàng)新院與德國(guó)萊茵TÜV大中華區(qū)、安徽省產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)研究院及山東省產(chǎn)品質(zhì)量檢驗(yàn)研究院合作成立“提升新能源汽車高壓零部件能效與安全性”項(xiàng)目測(cè)試實(shí)驗(yàn)室。

2022年6月，合肥創(chuàng)新院旗下科學(xué)島創(chuàng)客空間成功晉升為國(guó)家級(jí)眾創(chuàng)空間。

2022年8月，合肥創(chuàng)新院孵化培育企業(yè)中科中渙、中科美絡(luò)、中科海奧入選國(guó)家級(jí)專精特新“小巨人”企業(yè)。

2023年7月，合肥創(chuàng)新院園區(qū)黨委正式成立。

2023年10月，合肥創(chuàng)新院二期項(xiàng)目正式投入使用。